[R] 상관계수행렬 그리는 법 (psych 패키지 이용) - 이게 젤 나음

1. 데이터 

iris 데이터를 이용합니다. 

> head(iris)
  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa
5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa
6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa

Species 는 수치형 데이터가 아니므로 제거해줍니다. 

> data=iris[,1:4]
> head(data)
  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
1          5.1         3.5          1.4         0.2
2          4.9         3.0          1.4         0.2
3          4.7         3.2          1.3         0.2
4          4.6         3.1          1.5         0.2
5          5.0         3.6          1.4         0.2
6          5.4         3.9          1.7         0.4

 

2. 그래프

psych 패키지의 pairs.panels 함수를 사용합니다. 

 

library(psych)
pairs.panels(data)

 

 

3. 그래프 (데이터 점 색 구분)

인스턴스 별로 어떤 피처에 속했는지에 따라 색을 구분해봅시다. 위 데이터에서는 Species 별로 색을 구분합니다. bg 옵션을 사용합니다. 점의 색이 나타나도록 pch 도 21로 수정해줍니다. 

 

pairs.panels(data, 
             bg=rainbow(3)[iris$Species],
             pch=21)

 

 

4. 그래프 (유의한 정도 표시)

상관계수가 유의한 정도를 * 별표를 이용하여 표시합니다. stars 옵션을 TRUE로 하면 됩니다. 

 

pairs.panels(data, 
             bg=rainbow(3)[iris$Species],
             pch=21,
             stars=TRUE)